Laboratorio de Biología Molecular y Celular del Cáncer

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Vigilancia genómica SARS-CoV2 y otros patógenos
FIC 40041031-0
2022

Gracias a este proyecto se implementó en el laboratorio una Unidad de vigilancia genómica utilizando la tecnología desarrollada por la empresa Oxford Nanopore Technologies® (ONT). Se secuenciaron muestras positivas para CoViD-19, patógenos de interés sanitario de la región de Coquimbo y además se secuenciaron algunos genes asociados a cáncer, de modo de iniciar el desarrollo de medicina personalizada en la región.

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Historia​

Laboratorio CáncerLab se funda en el año 2010 a cargo del Dr. Giuliano Bernal, en el Departamento de Ciencias Biomédicas de la Universidad Católica del Norte, con aportes del proyecto FONIS SA10I20042 “Análisis de genes predictores de cáncer gástrico y Helicobacter pylori, en deposiciones de pacientes derivados de atención primaria para endoscopía digestiva alta GES en Hospital San Pablo de Coquimbo”.

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Líneas de Investigación

CáncerLab

Diagnóstico molecular de Helicobacter pylori y su relación con cáncer gástrico
Diagnóstico y genotipificación de virus papiloma humano (VPH) y su relación con cáncer cervicouterino.
Secuenciación de patógenos mediante tecnología Oxford Nanopore y análisis metagenómicos
Determinación de mutaciones en BRCA1 y BRCA2 y prevención del cáncer de mama
Evaluación in vitro de compuestos, como coadyuvantes para el tratamiento del cáncer

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Patentes

Bernal G, Häberle S. Método para la identificación de infección por Helicobacter pylori mediante la detección de los genes ureC y cagA, en muestras fecales. INAPI, Nº registro patente 57150.

Poblete R, Cortés E, Bernal G, Aquea G, Chacana J, Bonilla E, Morales N. Sistema y Procedimiento de tratamiento terciario de aguas residuales domiciliarias (para eliminar el CoViD-19). INAPI, Nº registro patente 68622.

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Vigilancia genómica de SARS-CoV2 y otros patógenos.

FIC 40041031-0. 2022.
El 30 de Enero de 2020, la Organización Mundial de la Salud declara al Síndrome Respiratorio Agudo Severo (SARS, por su sigla en inglés) causado por coronavirus-2 (CoV-2), como una epidemia de impacto internacional. En Chile, a través del programa de vigilancia genómica, se han secuenciado un total de 3.441 casos confirmados de SARS-CoV-2 entre el 22 de diciembre de 2020 y el 25 de junio de 2021, detectándose variantes de preocupación en un 51,0% (n= 1.756) y variantes de interés en Salud Pública (VOI) en un 26,5% (n= 911) del total de muestras de casos. El 24 de junio se informa la detección del primer caso de la variante DELTA en Chile. Ante esta necesidad de laboratorios de secuenciación, CáncerLab aprobado por ISP para procesar muestras de SARS-CoV-2, creó la primera Unidad de Vigilancia Genómica de la Región de Coquimbo que hizó frente a la aparición de nuevas variantes de este virus, así como de cualquier otro patógeno emergente de interés para la salud pública. Con este proyecto se adquirió un secuenciador modelo MinIon, de Oxford Nanopore Technologies®, el que nos permitió realizar los análisis de secuencia en el laboratorio e incorporar a la región de Coquimbo a la Red Nacional de Vigilancia Genómica de SARS-CoV2, de modo de fortalecer la capacidad de secuenciación en el país y así aumentar la cantidad de datos para apoyar el desarrollo de protocolos de diagnósticos.